Regenerácia batérie do notebooku je proces omnoho zložitejší než samotná výmena článkov. Kľúčovým krokom je preprogramovanie riadiaceho kontroléra batérie, ktorý zabezpečuje správnu spoluprácu s notebookom. Práve v kontroléri sú uložené všetky dôležité parametre – kapacita akumulátora, pôvodná aj celková kapacita, počet nabíjacích cyklov či typ chemickej technológie použitých článkov. Bez správnej úpravy týchto údajov, teda bez opätovného naprogramovania kontroléra, batéria nebude v zariadení pracovať správne. V rámci regenerácie preto vždy vykonávame kompletné preprogramovanie kontroléra, aby boli jeho parametre prispôsobené novým článkom.

Najčastejšie pracujeme s kontrolérmi značiek Texas Instruments a Maxim. Vďaka správnemu naprogramovaniu a použitiu značkových článkov zregenerovaná batéria opäť dosahuje plnú funkčnosť a životnosť porovnateľnú s novou.